FC Heliosel on kokku 22 treeninggruppi. Suurem osa nendest on noortegrupid, millele lisanduvad mehed, naised, väravavahtid ning ÜKE treeningud. Treeningud toimuvad Tartu linnas ja Lähtel.
Lisaks neile on FC Heliosel ka lasteaiagrupid – kokku 9 lasteaias.
